例えば、■に●を合成するとします。
●部分を[長方形領域の選択]ツールで選択し、■部分へ移動すると、 ●画像の余白部分までが合成されてしまいます。
こういった場合には範囲を解除する前に、[選択範囲の背景色を透過]ボタンをタップしてオンの状態にしてください。
この状態で範囲外をタップして範囲を解除すると、選択範囲内の背景色部分が透過・合成されます。
合成については、他にもレイヤを使った方法や、そもそも長方形選択ではなく自由選択などで●の形に選択してから移動する、と言った方法があります。やりやすい方法で行ってください。